| 序号 | 中学名称 | 建立年份 | 月份 | 备注 |
| 1 | 南京市第九中学 | 2002 | 4 | 东大英才班 |
| 2 | 江苏省六合高级中学 | 2005 | 6 | |
| 3 | 江苏省溧水高级中学 | 2005 | 6 | |
| 4 | 江苏省高淳高级中学 | 2006 | 7 | |
| 5 | 江苏省江浦高级中学 | 2008 | 6 | |
| 6 | 南京师范大学附属中学 | 2010 | 12 | 毫米波国家重点实验室青少年科普基地 生物分子电子学国家重点实验室青少年科普基地 |
| 7 | 南京师范大学附属扬子中学 | 2013 | 5 | |
| 8 | 金陵中学 | 2013 | 5 | 东大-金中卓工培养计划 |
| 9 | 南京市第一中学 | 2013 | 5 | |
| 10 | 南京市第十三中学 | 2013 | 12 | |
| 11 | 南京东山外国语学校 | 2016 | 3 | |
| 12 | 南京市中华中学 | 2018 | 1 | |
| 13 | 南京市第二十九中学 | 2018 | 3 | |
| 14 | 南京市宁海中学 | 2018 | 5 | |
| 15 | 南京师范大学附属中学江宁分校 | 2018 | 5 |
